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玉米矮花葉病毒分離物基因組克隆及多樣性分析

張虎; 景曉雅; 孫柳清; 崔愛民; 張鵬華; 單皓; 陳偉 山西省農業科學院小麥研究所; 山西臨汾041000; 2; 山西師范大學生命科學學院; 山西臨汾041000
  • 玉米
  • scmv
  • 基因組
  • 多樣性

摘要:玉米是重要的糧食和經濟作物,在國民經濟中占有重要地位。玉米矮花葉病毒(Sugercan mosaic virus,SCMV)廣泛分布在世界各玉米主產區,嚴重威脅玉米的安全生產。系統研究SCMV的發生危害、遺傳結構與進化機制,對病毒病的防治具有重要意義。從山西省4個玉米主產區采集122個玉米葉片樣品(2015年62份,2016年60份)。經RT-PCR檢測證實36個樣品(2015年20個樣品,2016年16個樣品)為SCMV陽性,且廣泛分布于山西省玉米各個產區。從這些陽性樣品中分離、測序、克隆得到了一個新的SCMV分離物,該分離物(包括5’-UTR和3’-UTR端)基因組全長9 539 bp,編碼3 063個氨基酸。該分離物與26個SCMV分離物(NCBI)進行一致率、系統發育分析表明SCMV存在較大遺傳變異,27個分離物被劃分為3個與地理位置無明顯相關性的不同進化群體。選擇壓力分析表明,負向選擇可能是SCMV遺傳變異的原因之一。對變異位點統計分析發現,該結果將為評估SCMV在中國的流行病學特征奠定基礎,有助于SCMV的長期可持續防控策略的制定。

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中國農業科技導報

  • 預計1-3個月 預計審稿周期
  • 1.35 影響因子
  • 農業 快捷分類
  • 月刊 出版周期

主管單位:中華人民共和國科學技術部;主辦單位:中國農村技術開發中心

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