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福建與山東、遼寧養(yǎng)殖仿刺參腸道菌群結構的差異分析

陸振 福建省水產研究所; 福建省海洋生物增養(yǎng)殖與高值化利用重點實驗室; 福建廈門361013
  • miseq高通量測序
  • 仿刺參
  • 腸道菌群

摘要:該研究基于MiSeq高通量測序技術對大連、煙臺、霞浦和莆田地區(qū)養(yǎng)殖仿刺參( Apostichopus japonicus )腸道菌落結構進行分析。結果表明,大連、煙臺、霞浦和莆田地區(qū)養(yǎng)殖仿刺參腸道測得的分類操作單元(OTUs)分別為455、542、440和242。四個樣品菌群的物種豐度和優(yōu)勢菌種存在較大差別,其中莆田池塘養(yǎng)殖的仿刺參的腸道菌群比霞浦海上吊籠養(yǎng)殖高2倍多。煙臺的仿刺參的豐富度最高,Simpson/Shannon指數達到4.78。四個產地仿刺參腸道中共檢測到317個細菌種屬。大連養(yǎng)殖仿刺參腸道的主要優(yōu)勢菌群為 Lutibacter (10.13%),屬擬桿菌門的黃桿菌科,是一種兼性厭氧菌。煙臺養(yǎng)殖仿刺參腸道的主要優(yōu)勢菌群為 Haliea (21.34%)和 Halioglobus (12.58%)。莆田養(yǎng)殖仿刺參腸道中乳球菌屬( Lactococcus )、芽孢桿菌屬( Bacillus )所占比例較高。在霞浦養(yǎng)殖仿刺參腸道中 Formosa 含量最高,占細菌總數的比例為87.06%,其次為乳球菌屬( Lactococcus ),占細菌總數比例為7.71%。文章利用Miseq高通量測序技術對仿刺參腸道菌群結構進行分析,為今后進一步研究仿刺參腸道菌群與其攝食、消化、免疫等之間的關系提供了新的資料。

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漁業(yè)研究

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主管單位:福建省海洋與漁業(yè)局;主辦單位:福建省水產學會;福建省水產研究所

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