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可變剪接與蛋白質結構多樣性

李敏 劉國慶 蔡祿 內蒙古科技大學數理與生物工程學院 內蒙古包頭014010 內蒙古科技大學生物工程與技術研究所 內蒙古包頭014010
  • 可變剪接
  • 蛋白質結構
  • 蛋白質穩定性
  • 疏水非均一性

摘要:研究可變剪接和蛋白質結構多樣性之間的相關性,對于理解可變剪接的功能具有重要意義。已有研究支持可變剪接增加蛋白質結構多樣性的觀點,但可變剪接影響蛋白質結構的程度、機制等還尚未闡明。作者基于具有確定三維結構的可變剪接蛋白質變體數據,從蛋白質結構差異和結構穩定性兩個方面對致病和非致病的可變剪接蛋白質變體對進行了比較分析;通過建立實際可變剪接變體集和隨機可變剪接變體集,并定義蛋白質的多樣性增量(increment of diversity,ID)和疏水非均一性(hydrophobic non-uniformity,HI),研究了可變剪接發生的非隨機性。結果表明:現有的多數可變剪接事件與隨機剪接相比,傾向于增加蛋白質結構多樣性;產生結構差異較大蛋白質的可變剪接事件傾向于導致疾病的發生。作者還提出了正負選擇壓力的動態平衡假說解釋這一現象,認為與生命活動相聯系的正選擇壓力促使增加蛋白質結構多樣性的可變剪接事件在群體中固定,但反向的負選擇壓力約束著可變剪接改變蛋白質結構的尺度,細胞中現有的可變剪接正是這兩種正負選擇壓力之間保持動態平衡的結果。

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生物物理學報

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主管單位:中國科學技術協會;主辦單位:中國生物物理學會;中國科學院生物物理研究所

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