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玫瑰β-1,3-葡聚糖合成酶基因(RrCalS)克隆與生物信息學(xué)分析

康希泉; 亓帥; 臧德奎; 鄭林; 徐宗大; 邢樹堂; 于曉艷 勝利油田勝大園林工程有限公司; 山東東營257000; 山東農(nóng)業(yè)大學(xué); 山東泰安271000; 青州市花卉產(chǎn)業(yè)管理局; 山東青州262500
  • 玫瑰
  • 基因克隆

摘要:為了探明胼胝質(zhì)對玫瑰授粉親和性的影響,本研究以‘唐紅’玫瑰花柱為試材,采用RT-PCR和RACE方法獲得了玫瑰β-1,3-葡聚糖合成酶基因的cDNA全長,命名為RrCalS。該基因全長5742 bp,開放閱讀框5295 bp,編碼1764個氨基酸。推導(dǎo)編碼蛋白的分子量為204.7kD, PI值為9.00,在164-265位具有pfam14288結(jié)構(gòu)域,在869-1642位具有pfam02364保守結(jié)構(gòu)域,屬于葡聚糖合成酶超家族;該蛋白屬于疏水性、非分泌型蛋白,具有16個跨膜結(jié)構(gòu)域,含有32個Ser磷酸化位點、21個Thr磷酸化位點、12個Tyr磷酸化位點;該蛋白的α-螺旋占49.49%,無規(guī)則卷曲占22.68%,β-轉(zhuǎn)角占7.94%;該蛋白與Fragaria vesca等8種植物的Cals氨基酸序列同源性達73%以上,且它們的系統(tǒng)進化關(guān)系與傳統(tǒng)分類結(jié)果一致。本研究為進一步深入研究玫瑰授粉不親和機理,提高玫瑰育種理論和技術(shù)水平奠定了基礎(chǔ)。

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山東林業(yè)科技

  • 預(yù)計1個月內(nèi) 預(yù)計審稿周期
  • 0.39 影響因子
  • 農(nóng)業(yè) 快捷分類
  • 雙月刊 出版周期

主管單位:山東省自然資源廳;主辦單位:山東省林業(yè)科學(xué)研究院;山東林學(xué)會

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