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北京鴨BNIP3L基因CDS區(qū)克隆及序列分析

甘偉; 任小春; 任小松 四川省達(dá)州市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究院; 四川達(dá)州635000
  • 北京鴨
  • bnip3l
  • 基因克隆
  • 序列分析

摘要:BNIP3L定位于線粒體,廣泛分布于各個(gè)組織中,具有促凋亡的作用。根據(jù)NCBI上鴨BNIP3L基因預(yù)測(cè)序列設(shè)計(jì)引物,利用PCR技術(shù),對(duì)鴨BNIP3L基因CDS區(qū)序列進(jìn)行克隆。結(jié)果表明:擴(kuò)增出BNIP3L基因的CDS區(qū)序列全長(zhǎng)為543bp,編碼180個(gè)氨基酸,相對(duì)分子質(zhì)量為19.52ku,理論等電點(diǎn)為6.334。另外,該氨基酸序列存在典型的3個(gè)低密度區(qū)域和1個(gè)跨膜結(jié)構(gòu)域。經(jīng)比對(duì)分析發(fā)現(xiàn)鴨的BNIP3L基因具有特有的保守序列,而且與鳥類的BNIP3L基因具有較高的相似性,并對(duì)其氨基酸序列和蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)進(jìn)行了分析,整個(gè)多肽鏈中疏水性氨基酸為151個(gè),親水性氨基酸為29個(gè),因此整個(gè)多肽鏈應(yīng)為疏水性。其蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)由α-螺旋、β-轉(zhuǎn)角、延伸鏈和無(wú)規(guī)則卷曲組成,分別占22.78%、7.22%、17.78%和52.22%。以上數(shù)據(jù)表明北京鴨 BNIP3L基因CDS區(qū)序列與安氏蜂鳥、朱鷯、雞具有較高的一致性,且在物種進(jìn)化過程中較為保守。

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