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miR-1246和miR-1261在模擬失重48 h后人肺微血管內皮細胞中的表達及生物信息學分析

高原; 徐沁; 褚孟洋; 張麗君; 李程飛; 石菲; 孫喜慶; 趙疆東; 閆銘; 王永春 第四軍醫大學航空航天醫學系航空航天生物動力學教研室; 陜西西安710032; 第四軍醫大學學員一旅; 陜西西安710032; 第四軍醫大學西京醫院骨科; 陜西西安710032
  • 模擬失重
  • 血管內皮細胞
  • 生物信息學

摘要:目的:檢測模擬失重48 h人肺微血管內皮細胞(HMVEC-L)miR-1246和miR-1261表達的改變,利用生物信息學方法分析預測其靶基因。方法:以回轉器行模擬失重效應48 h的HMVEC-L為模擬失重組,同時設正常重力對照組,比較兩組細胞miRNA表達譜的變化,應用Real-time PCR檢測HMVEC-L細胞miR-1246和miR-1261的表達,通過Target Scan、miRDB和miRanda對miR-1246和miR-1261的靶基因進行預測以及功能注釋和通路富集分析。結果:與正常重力對照組比較,模擬失重48 h可引起HMVEC-L細胞中29種miRNA呈現顯著差異性表達,miR-1246和miR-1261顯著降低,差異有統計學意義(P〈0.05);生物信息學分析顯示miR-1246和miR-1261的靶基因涉及生物過程、分子功能及細胞組成等多種功能,主要參與了磷酸化通路、凋亡相關通路和細胞骨架等相關分子的調控。結論:模擬失重48 h后可引起HMVEC-L細胞miR-1246和miR-1261的表達降低,提示其可能參與了模擬失重后內皮細胞功能異常的調控。

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貴陽醫學院學報

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