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電離輻射對人舌鱗癌CAL-27細胞影響的生物信息學分析

胡松玲; 胡慶玲; 王衛平; 何祥一; 黨秉榮; 邵春林 復旦大學放射醫學研究所; 上海200032; 蘭州大學口腔醫學研究所; 蘭州730000; 中國科學院近代物理研究所; 蘭州730000; 德州市人民醫院口腔科; 德州253000
  • 重離子
  • microrna
  • 輻射

摘要:通過生物信息學方法分析不同輻射源照射對人舌鱗癌CAL-27細胞基因表達譜的影響,為臨床篩選口腔腫瘤放射治療相關分子標志物提供參考.利用X射線和重離子照射CAL-27細胞,運用克隆存活實驗及流式細胞術檢測細胞存活率及凋亡率;進一步應用高通量測序技術篩選受照射細胞差異表達的miRNAs,并對差異表達基因進行生物學功能及代謝通路富集分析,以探討其分子損傷機理.結果表明,X射線及重離子照射CAL-27細胞后,細胞存活率分別為88%、71%,細胞凋亡率分別為13.9%、30.4%.通過高通量測序技術檢測分析發現,與X射線輻照組相比,重離子輻照組共有33個miRNAs表達差異,其中有12個miRNAs表達上調,21個miRNAs表達下調;通過KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)數據庫在表達差異的miRNAs中篩選出了15條相關信號通路,如嗅覺傳導通路、細胞因子受體交互通路、絲裂原活化蛋白激酶信號通路等.結果提示,在相同吸收劑量條件下,相比于X射線,重離子輻射對CAL-27細胞miRNA表達譜的影響較大,其變化機理可能與MAPK信號傳導通路有關.

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輻射研究與輻射工藝學報

  • 預計1-3個月 預計審稿周期
  • 0.74 影響因子
  • 科學 快捷分類
  • 雙月刊 出版周期

主管單位:中國科學院;主辦單位:中國科學院上海應用物理研究所

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