首頁 > 期刊 > 自然科學與工程技術 > 工程科技II > 核科學技術 > 輻射研究與輻射工藝學報 > 電離輻射對人舌鱗癌CAL-27細胞影響的生物信息學分析 【正文】
摘要:通過生物信息學方法分析不同輻射源照射對人舌鱗癌CAL-27細胞基因表達譜的影響,為臨床篩選口腔腫瘤放射治療相關分子標志物提供參考.利用X射線和重離子照射CAL-27細胞,運用克隆存活實驗及流式細胞術檢測細胞存活率及凋亡率;進一步應用高通量測序技術篩選受照射細胞差異表達的miRNAs,并對差異表達基因進行生物學功能及代謝通路富集分析,以探討其分子損傷機理.結果表明,X射線及重離子照射CAL-27細胞后,細胞存活率分別為88%、71%,細胞凋亡率分別為13.9%、30.4%.通過高通量測序技術檢測分析發現,與X射線輻照組相比,重離子輻照組共有33個miRNAs表達差異,其中有12個miRNAs表達上調,21個miRNAs表達下調;通過KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)數據庫在表達差異的miRNAs中篩選出了15條相關信號通路,如嗅覺傳導通路、細胞因子受體交互通路、絲裂原活化蛋白激酶信號通路等.結果提示,在相同吸收劑量條件下,相比于X射線,重離子輻射對CAL-27細胞miRNA表達譜的影響較大,其變化機理可能與MAPK信號傳導通路有關.
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